Le LAGEP est structuré autour de trois grand pôles : un pôle de Physico-Chimistes, un pôle d’automatique et un pôle Génie des Procédés.Les équipes constituantes de ces pôles bénéficient du soutien de 4 services communs : le service Administratif et Financier, le service Ingénierie de Projets, le service Analyse et Instrumentation et le service Informatique.